کاربرد نشانگرهای مولکولی در اصلاح زیتون

چکیده

نشانگرهای مولکولی (DArT, SSR, SNP) و ویژگی های برزشناختی در بزرگترین مجموعه ژرم پلاسم زیتون دنیا (انجمن پژوهش و آموزش کشاورزی و شیلات، مرکز آلامدا دل آبیسپو، کوردوبا در اسپانیا) مورد استفاده قرار گرفته است تا الگوهای تنوع ژنتیکی و ساختار اصلی ژنتیکی را بین 361 شماره دسترسی زیتون بررسی کند. بعلاوه، داده های نشانگر برای ساخت گروهی از مجموعه های هسته با دو الگوریتم متفاوت (MSTRAT و پاورکور) برپایه استراتژی بیشینه سازی استفاده شدند. نتایج ما تصدیق می کنند که مجموعه ژرم پلاسم، منبعی سودمند از مواد گوناگون ژنتیکی است. هم چنین دریافتیم که خاستگاه جغرافیایی، عاملی مهم است که در زیتون تنوع ژنتیکی می سازد. زیرگروه های 18، 27، 36، 45و68 زیتون که به ترتیب %5، %7.5، %10، %12.5 و %19 را از کل مجموعه ژرم پلاسم نشان می دادند، براساس اطلاعات حاصل از همه گروه داده ها به همراه هر نوع نشانگر منفردا در نظر گرفته شده انتخاب شدند. طبق نتایج ما، مجموعه های هسته که بین %10 و %19 از کل اندازه مجموعه را نشان می دهند می توانند مناسب ترین مجموعه ها در حفظ قسمت عمده تنوع ژنتیکی یافت شده در این مجموعه در نظر گرفته شوند. به سبب کارایی بالای آن در جذب همه وضعیت های الل/ویژگی های یافت شده در کل مجموعه، اندازه هسته دسترسی های شماره 68 می تواند حائز اهمیت خاصی برای کاربردهای حفظ ژنتیکی در زیتون باشد. میانگین بالای فاصله ژنتیکی و تنوع و نمایندگی تقریبا برابر دسترسی ها از مناطق جغرافیایی متفاوت بیان می کنند که اندازه هسته از دسترسی های 36 می تواند مجموعه کارآمد برای پرورش دهندگان زیتون باشد.

کلیدواژه ها: ژرم پلاسم زیتون، تنوع ژنتیکی، گروه های مرکزی، نشانگرهای مولکولی، پرورش زیتون

مقدمه

در بیشتر کشت ها، تاکید زیادی بر گردآوری و حفظ منابع ژنتیکی شده است که منجر به استقرار بانک های ژرم پلاسم آفسایت در سرتاسر جهان شده است. اهداف بنیادین یک بانک ژرم پلاسم حصول، حفظ، اثبات، ارزیابی و ایجاد تنوع ژنتیکی گیاه نماینده قابل حصول از کشت مورد نظر است. اگرچه، علی رغم توسعه قابل ملاحظه به دست آمده در دهه های اخیر جهت جلوگیری از زوال ژنتیکی بسیاری از گونه های کشت، هنوز فاصله زیادی بین تنوع ژرم پلاسم در دسترس گردآوری شده و استفاده موثر آن وجود دارد (ون هینتوم و همکاران 2000).